版本一 在21世纪晚期，人们发现了一张星际地图，这张地图似乎讲述了人类的由来和秘密。这张图似乎将马格达兰文化、中美洲文化和米索不达米亚文化联系在了一起。 为了搞明白这张星际地图所蕴含的秘密，韦兰公司派出了一艘叫做"普罗米修斯"的科学考察船，前往星际的内部去探寻人类的起源和最初的秘密。 很快，科考船按照地图找到了目的地，发现了外星种族和它们的文明。而与此同时，这些参与科考项目的科学家们也发现自己的生命正处在危险之中…… 版本二 21世纪末，人类的科技水平已高度发达，克隆人技术和宇宙航行早已实现，不再是梦想。与此同时，许多科学家仍孜孜不倦追索着人类起源的秘密与真相。通过对许多古老文明的考察与对比，科学家伊丽莎白·肖（Noomi Rapace 饰）和查理·赫洛维（Logan Marshall-Green 饰）发现，人类可能是来自一个遥远星系的外星人创造的。在Weyland公司资助下，他们乘坐维克丝（查理兹·塞隆 Charlize Theron 饰）所掌管的宇宙飞船普罗米修斯号前往那颗未知的星球。 经过对当地的考察，地球人的设想成功得到印证。可是他们贸然探查“神的秘密”的行为，也将自己引入万劫不复的深渊…… 版本三 雷德利·斯科特在本片中将重归他最引以为傲的类型，打造一个原创科幻史诗，而故事则被设置在宇宙中最危险的角落。影片讲述一队科学家开展了一场惊悚的探险之旅，这一切将考验他们生理和精神上的局限，并让他们滞留在一个完全不同的世界，在那里他们会发现困扰人类已久的终极问题的答案，以及生命的终极之谜。 版本四 一个团队在地球上发现了人类起源的线索，这个线索引领他们踏上太空之旅，来到了一个宇宙中最黑暗的角落。在那里，他们必须血战到底以保护人类在未来不被毁灭。