《神童》改编自1981年法国畅销书冠军《神奇少年》（La Nuit des enfants rois），它的作者是Bernard Lentéric。本片制作人Marc Missonnier自小就是本书的粉丝，一直希望能将这部作品搬上大银幕，2002年他取得了原著的改编权，并开始筹备将这部作品电影化。《神童》由Marc Missonnier和他的老搭档Olivier Delbosc联合制作，他们曾联合参与制作了电影《8美图》、《詹妮斯和约翰》、《蛇》、《莫里哀情史》等等，并曾与保罗·哈吉斯联合制作影片《危情三日》。
编剧方面，原著作者Bernard Lentéric也作为顾问，为改编剧本提出了参考性的意见，但是Lentéric认为自己如今年纪大了，写出来的东西可能不再会在青少年中流行，因此他并没有加入剧本写作的行列。电影中“神奇少年”的超能力与书中略有不同，除了拥有控制他人精神的能力之外，在电影里，这些孩子们还可以控制他人的身体。此外，书中大幅描写的暴力以及大洪水的场景在影片中有所删减。
在人物设定上，《神童》希望能够走手绘、写实风的路线，制作组参考了押井守《攻壳机动队》的画风。为了再现纽约市和其他很多真实世界场景，制作组在绘制过程中也参考并临摹了大量图片资料。在视效方面，导演专门邀请了为游戏改编电影制作视频和视效的团队，并且请来了漫威（惊奇）公司的两位设计师协助制作本片，其中一位设计师是电子游戏《半条命2》的视频制作人Viktor Antonov。如果说本片画风是受了日漫和美漫的启发，那么这些人则确保了《神童》拥有自己独特的美学风格。
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