明朝末年，宦官专权，东厂曹少钦（甄子丹 饰）假造圣旨、杀害忠良，侠女邱莫言（林青霞 饰）、江湖义士贺虎（任世官 饰）等人救出忠良后代，逃至龙门客栈，与杨将军部下周淮安（梁家辉 饰）会合。龙门客栈是一家乱世中的黑店，客栈老板娘金镶玉（张曼玉 饰）利用自己的美貌作诱饵杀人越货聚敛钱财，但她却对周淮安动真心。为摸清通往外面的暗道，周淮安答应与金镶玉结为夫妻。在洞房花烛夜，楼上的周淮安和金镶玉各怀心思，暗中较量；楼下的邱莫言、贺虎等人与东厂展开生死搏斗。在激烈的战斗中，许多人丧生。曹少钦赶到现场，邱莫言被乱箭射中受伤。金镶玉带着周淮安、邱莫言以及两个孩子在刁不遇的掩护下，通过暗道成功逃离。当他们冲出暗道时，被曹少钦发现。金镶玉将两个孩子托付给刁不遇，让他们离开。三人联手对抗曹少钦，邱莫言战死，周淮安和金镶玉与刁不遇一起击败曹少钦。治好伤后，周淮安离开龙门客栈。最终，金镶玉放火烧毁龙门客栈，与周淮安一同离开。