根据好莱坞电影运作的惯例，一部好的剧本是完成高质量电影的坚实基础。为此，Viridian娱乐公司斥资300万美元聘请了好莱坞著名编剧、历史学家、历史剧《罗马》的作者威廉·麦克唐纳打造《南京浩劫》剧本。麦克唐纳先生曾亲临南京实地考察并先后三易其稿，多次邀请南京大屠杀史研究专家研读剧本，并就有关史实方面的细节和中国上世纪30年代的生活习惯进行推敲。专家们对剧本给予高度肯定，认为剧本尊重史实，结构合理，剧情设计巧妙，是他们“迄今为止看到的有关南京大屠杀题材的最好剧本”。