【创作背景】
编剧王兴东、王浙滨、刘子成去齐齐哈尔扎龙自然保护区体验生活时，他们了解了丹顶鹤的生活习性，冬去春来的迁徙，母鹤对小鹤的爱怜让他们受到感动，决定写动物性与人性的统一，写鸟归巢、人返故里、留恋养育自己故乡的主题，表现伟大的母爱，创作了电影文学剧本《飞来的仙鹤》。而给他们留下深刻印象的农民出身的养鹤专家徐铁林就成为贺凤翥的原型。在创作过程中，他们都调动了各自的生活经验。刘子成、王浙滨的母亲都人工孵化过小鸡，因此在剧本中写了人工孵化小鹤的情节。刘子成曾受人之托把一盒剥了壳的葵花籽给在外地的儿子，他也把那个故事写进剧本中。
本片摄影师张保之本是专拍科教片的，1981年，他为拍摄《丹顶鹤的一家》深入扎龙自然保护区，邂逅长影的编辑王兴东。因为张保之对当地环境，以及鹤的生态习性比较熟悉，王兴东就邀请他参加《飞来的仙鹤》的摄影工作。
【剧本修改】
导演陈家林第一次读完剧本后被内容的诗意所陶醉，被人物感动，但又觉得故事简单，人物少，戏散，情节线单一。为了开掘主题，他和编剧总结出故事的三层含义：小翔回鹤乡反映人不会忘记养育之恩，落叶归根是中华民族的传统美德；小翔寻母的过程反映了人与人之间的新道德风尚；小翔跑回鹤乡反映了孩子的兴趣是个重要问题，家长要善于引导和启发孩子。反复研究后，他们认为应该突出第二、三层含义，写人的心灵之美。
在这一基础上，他们对原剧本进行修改，把初稿中两母夺子改为两母让子，删去白鹭数次寻子的过程，加快情节进度，从而为刻画两位母亲的崇高内心世界和体现影片主题思想服务。
【拍摄现场】
渔民贺凤翥和其子小翔的水中戏是在秋天拍摄的，外景地气温非常低，工作人员都穿上了皮大衣，可演员王尚信和杨通却得光着膀子下水拍戏。为了鼓舞他们，导演、副导演带头跳下水。
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