版本一 所有的一切都是围绕着一个由政府负责研发的最新的秘密计划展开的，他们正在有组织地训练动物去完成人类不可能涉足到的间谍侦察任务，于是就出现了那么几只全身都被最先进的高科技设备重重地武装起来的小豚鼠，在经历了层层关卡的测试和筛选之后，终于顺利通过考试，正式成为特工。可是让他们始料不及的是，在这个过程中，整个世界最终的命运，竟然都掌握在了他们小小的爪子里。 “豚鼠特工队”的成员分别包括：达尔文(山姆·洛克威尔配音)，身为队长的他，拥有着冷静的头脑和敏锐的判断力，更有着坚韧的毅力，是那种不惜任何代表都要取得决胜性的成功的天生领袖；布拉斯特(崔西·摩根配音)则是一个冷酷无情的武器专家，总是喜欢表达过多的姿态和看法，对于任何极端的事物都有着极大的兴趣；队里惟一的雌性成员华雷丝(佩内洛普·克鲁兹配音)性感美丽，却是一个非常擅长近身搏斗的职业武术家；最后是被称为“永远不可能被察觉”的侦察员斯派克尔斯(尼古拉斯·凯奇配音)，他是一只星鼻鼹，同时也是小分队里的电脑专家和信息技术人员。 一路走来，“豚鼠特工队”在执行任务的时候，结识了无数个来自于另外一个动物王国的成员，包括生长在宠物店的“懒家伙”赫尔利(乔恩·费儒配音)，还有一只拥有着强烈的领地意识的仓鼠巴基(史蒂夫·布西密配音)，他们将一起展开一场惊险到让人眼花缭乱且非常疯狂的危险之旅，而他们所做到的一切，再一次用事实证明了--不管身高尺寸有多大，都可以成为这个世界迫切需要的真正的英雄。 版本二 科学家本（Zach Galifianakis 饰）隶属于美国政府某个秘密部门，它通过高科技手段训练豚鼠说话与思考，并将它们培养成特工人员。然而，本的部门却面临被FBI关闭的局面，为了证明他和豚鼠特工的能力，本向豚鼠特工队的负责鼠达尔文（山姆·洛克威尔 Sam Rockwell 配音）下令，要它们潜入赛博林工业的CEO罗纳德·赛博（Bill Nighy 饰）的办公室，寻找罗纳德向中东国家出卖可用于军事的高科技芯片的证据。达尔文毫不怠慢，带着布拉斯特（崔西·摩根 Tracy Morgan 配音）、华蕾斯（佩内洛普·克鲁兹 Penélope Cruz 配音）、苍蝇莫奇和斯贝克斯（尼古拉斯·凯奇 Nicolas Cage 配音）等成员迅速展开行动。 这群豚鼠特工队员体型虽小，却身怀绝技，它们成功闯入罗纳德的办公室，并下载到重要资料。然而，这场冒险才刚刚开始…… 版本三 一个秘密政府组织训练动物们去执行间谍行动。当这些经过强化训练的豚鼠们全身武装上最先进的设备之后，它们发现地球的命运掌握在它们手中。“达尔文”（山姆·洛克威尔 配音）是他们的头儿，决定要不惜一切代价取得胜利；Blaster（崔西·摩根 配音）是一个出色的武器专家；由佩内洛普·克鲁兹配音的Juarez是一个性感的武功高手，另外，这个团队还有会飞檐走壁的侦查员Mooch，以及精通电脑技术的专家鼹鼠Speckles（尼古拉斯·凯奇 配音）。